W skład kierownictwa Muzeum Sztuki Nowoczesnej w Warszawie wchodzą:
 
Dyrektorka Muzeum - Joanna Mytkowska
  
Zastępcy dyrektorki:

Szymon Żydek, z-ca ds. programowych

Marta Bartkowska - z-czyni ds. komunikacji

Maria Szybińska - z-czyni ds. infrastruktury

Justyna Kesler - z-czyni ds. operacyjnych

Anna Brokman - Główna Księgowa